专利合同存在纠纷如何处理
协商、诉讼。1、协商解决。协商解决是指发生侵权案件以后,双方当事人直接进行磋商,以达成解决争议办法的处理方式。
2、向人民法院起诉。被侵权人认为他人侵犯其专利权，不愿协商解决或者协商解决不成的，得以侵权人为被告，依照民事诉讼法的规定，提起民事诉讼。
3、行政处理。按照本条的规定，专利侵权纠纷的当事人如果不愿直接向人民法院起诉，以"打官司"方式来解决争议的，可以请求管理专利工作的部门处理。
4．行政调解。依照本条的规定，进行调解的机关，应是对专利侵权纠纷作出行政处理的同一个管理专利工作的部门。
法律依据：
《专利法》第六十条
未经专利权人许可，实施其专利，即侵犯其专利权，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，专利权人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求管理专利工作的部门处理。